
近期,大连理工大学刘猛教授、李久兴副教授团队开发了一种名为ADC(Aptamer-coupled droplet CRISPR/Cas12a,适体偶联液滴CRISPR/Cas12a)的创新型检测平台,通过结合结构切换适体、液滴微流控技术与CRISPR/Cas12a系统,实现了对癌症生物标志物sPD-L1蛋白的超灵敏检测。研究人员利用微液滴将反应体系分割成数以万计的微小单元,从而大幅提高局部反应物浓度并压制背景噪音,无需传统的核酸扩增步骤即可达到飞摩尔级的检测灵敏度。
该平台能在70分钟内完成自动化定量分析,且在肺癌患者血液样本的临床诊断中表现出极高的准确性。此外,该系统具有模块化优势,仅需更换适体序列即可快速适配多种蛋白质靶点,为癌症早期筛查和传染病诊断提供了一种快速、普适且高效的液体活检方案。相关研究以“Aptamer-Coupled Droplet CRISPR/Cas12a Enables Ultrasensitive sPD-L1 Detection”为题目,发表在期刊《Analytical Chemistry》上。
本文要点:
1. 研发背景与核心挑战
sPD-L1的重要性:sPD-L1是癌症早期诊断、免疫治疗分层和预后预测的重要液体活检生物标志物。
现有技术局限:传统的ELISA灵敏度不足(皮摩尔水平),且操作复杂;PCR方法测量的是核酸而非具有免疫活性的蛋白质。
CRISPR技术的局限:Cas12a系统虽具有信号放大能力,但通常依赖核酸预扩增来达到高灵敏度,增加了操作复杂性和污染风险。
2. ADC平台的工作原理
结构转换适体(ssApt):设计了一种特殊的适体结构,在没有目标蛋白时,阻断序列(BS)被扣留在适体上;当sPD-L1存在并与适体结合时,会触发构象变化,释放出BS。
Cas12a激活:释放出的BS作为激活剂,引导Cas12a开启对荧光报告分子的反式切割,产生荧光信号。
液滴微流控增强:将反应限制在皮升(picolitre)级液滴中。这种物理限制提升了局部试剂浓度,加速了反应动力学,同时抑制了背景荧光,从而在无需核酸扩增的情况下实现了超灵敏检测。
3. 主要性能指标
检测限(LOD):在缓冲液和复杂血清基质中均可达到 5 pM。
检测时间:整个流程(包括液滴生成、孵育和成像)在 70分钟内完成。
特异性:能有效区分同源免疫蛋白,选择性超过100倍。
诊断准确性:在肺癌患者和健康对照者的盲测血浆样本中,实现了 100% 的诊断准确性,结果与标准ELISA高度一致。
4. 平台优势与应用前景
模块化设计:该平台具有通用性。通过更换适体模块,已成功演示了对 SARS-CoV-2 刺突蛋白的灵敏检测。
临床潜力:ADC平台无需热循环或复杂的核酸处理,操作简便,适合临床实验室进行快速、超灵敏的液滴活检分析。
未来方向:未来可能集成自动化系统、开发基于智能手机的即时检测(POCT)系统,以及扩展到多重蛋白检测面板。

ADC平台(适体偶联液滴CRISPR/Cas12a)主要通过结构转换适体(ssApt)的信号转换与皮升级液滴微流控的物理富集效应相结合,实现了无需核酸扩增的飞摩尔(femtomolar)级超灵敏检测。
具体实现机制分为以下三个关键步骤:
1. 信号转换:从蛋白质到核酸激活剂
由于CRISPR/Cas12a系统本质上是以核酸为中心的,ADC平台设计了一种结构转换适体(ssApt)作为中介。
分子开关:适体序列与一个短的阻断序列(BS8)杂化形成双链。在没有目标蛋白时,阻断序列被扣留在适体上。
触发释放:当sPD-L1蛋白存在并与适体结合时,适体的构象发生变化,置换并释放出单链的阻断序列。这个释放出来的序列充当了DNA激活剂,引导Cas12a开启反式切割活性。
2. 液滴限制:物理协同增强效应(核心机制)
平台将反应体系分割成约400皮升的单分散微液滴,这种物理限制产生了三个协同效应,将灵敏度提升了约1000倍:
大幅提升局部浓度:液滴体积微小,使得试剂(ssApt, Cas12a)和目标蛋白的局部有效浓度比大宗溶液(bulk solution)提升了约3个数量级。这极大地增加了反应物间的碰撞频率,显著加速了反应动力学。
极度抑制背景噪声:检测体积从微升降至皮升,使得每个反应单元内的积分背景荧光信号成比例减小。
防止信号扩散:液滴间的物理隔离防止了已激活的Cas12a酶或被切割的荧光分子发生扩散混合。非特异性产生的信号被锁定在单个液滴中,不会在整个体系中累积,确保了高信噪比。
3. 数字化定量读数
通过对成千上万个液滴进行自动化荧光成像和阈值处理,平台可以精确区分“阳性”液滴和“阴性”液滴。
数字化计数:这种方法将复杂的连续信号转换为了简单的荧光液滴数量(NFD)计数。
超低检出限:即使在极低浓度下,只要有一个蛋白触发了一个液滴的荧光,就能被捕捉到。这使得平台在无需传统的PCR或HCR等核酸预扩增步骤的情况下,实现了5 pM的极低检测限。

图1 ssApt偶联液滴CRISPR/Cas12a(ADC)体系用于无扩增超灵敏检测 sPD-L1 的示意图。

图2 ssApt的构建与优化。(a) 适体工作模型:sPD-L1结合后置换阻断序列(BS),并释放激活寡核苷酸。(b) 母体MJ5CL适体及BS1–BS8变体的DNA序列。(c) 在与sPD-L1孵育30 min后,不同MJ5CL/BS8摩尔比条件下ssApt的荧光响应。(d) 阻断序列长度及组成对ssApt性能的影响(30 min检测)。数据表示为3次独立重复实验的平均值 ± 标准差。

图3 MJ5CL/BS8–Cas12a检测的管内验证。(a) MJ5CL/BS8–Cas12a检测体系工作原理:sPD-L1置换BS8,释放的链激活Cas12a/crRNA,并通过FQ-ssDNA的反式切割产生荧光。(b) 切割动力学时间过程曲线。红色:完整反应体系(+Cas12a,+crRNA,+sPD-L1);灰色:−sPD-L1;蓝色:−Cas12a;绿色:−sPD-L1/−Cas12a。(c) 在不同sPD-L1浓度条件下FQ-ssDNA切割过程中的实时荧光变化曲线。(d) 与50 nM sPD-L1或竞争分析物孵育后的终点荧光信号(1 h)。数据表示为3次独立重复实验的平均值 ± 标准差。

图4 用于无扩增sPD-L1定量的ADC检测。(a) 单分散皮升级液滴的明场显微图;比例尺:200 μm。(b) 存在或不存在1 nM sPD-L1条件下孵育后的荧光图像,以及 (c) 对应的液滴荧光信号,展示了体系的可行性验证结果。(d) ADC检测对递增浓度sPD-L1的响应。(e) 荧光液滴数量(NFD)与sPD-L1浓度之间的关系。(f) 特异性分析:1 nM sPD-L1及竞争蛋白(100 nM)对应的NFD值。数据表示为3次独立重复实验的平均值 ± 标准差。

图5 ADC检测在10% FBS中的检测性能。(a) 10% FBS中检测sPD-L1的荧光响应及 (b) 相应的ADC检测曲线图。(c) 特异性测试:在10% FBS中,1 nM sPD-L1及竞争分析物(100 nM)的NFD值。NFD:荧光液滴数量。数据表示为3次独立重复实验的平均值 ± 标准差。

图6 ADC检测的临床样本验证。(a) ADC平台通过检测血浆中的sPD-L1进行肺癌识别的检测结果。(b) ADC测得的肺癌患者(n = 10)与健康供体(n = 10)血浆中sPD-L1浓度;统计学显著性采用双尾t检验分析(**P < 0.01)。(c) ADC与ELISA对所有受试者sPD-L1水平测定结果的热图比较。数据表示为3次独立重复实验的平均值 ± 标准差。(d) ADC与参考ELISA对20份盲法临床样本检测结果的列联矩阵及性能指标。PPA:阳性预测一致率;NPA:阴性预测一致率。
论文链接:https://doi.org/10.1021/acs.analchem.6c00779
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